新藥研發(fā)是一座風(fēng)光無限的險峰，今天，征服這座險峰的關(guān)鍵節(jié)點出現(xiàn)了。10月29日，深勢科技在上海重磅發(fā)布新一代藥物計算設(shè)計平臺Hermite®，Hermite®致力于為藥物研發(fā)工作者提供在CADD中數(shù)據(jù)、算法、算力三位一體的一站式解決方案。作為AI for Science的引領(lǐng)者和踐行者，深勢科技高舉AI for Science的旗幟，開創(chuàng)性的提出“多尺度建模+機器學(xué)習(xí)+高性能計算”的科學(xué)研究新范式，打造了新一代人工智能分子模擬平臺。
發(fā)布會上，深勢披露了關(guān)于Hermite®平臺的諸多細節(jié)優(yōu)勢。基于AI、物理建模、高性能計算的Hermite®，在小分子藥物設(shè)計領(lǐng)域的核心功能包括：
UniFold-蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測與優(yōu)化；
Uni Docking-苗頭化合物的超高通量虛擬篩選；
Uni IFD-藥靶結(jié)合模式的精確預(yù)測；
Uni FEP-基于自由能微擾的先導(dǎo)化合物優(yōu)化。
首先，基于深度學(xué)習(xí)方法，Uni-Fold可以快速準(zhǔn)確、動態(tài)的預(yù)測蛋白三維結(jié)構(gòu)。還能快速預(yù)測超大對稱蛋白高聚體，通過開源代碼、參數(shù)和數(shù)據(jù)集，Uni-Fold較以往平臺訓(xùn)練時間至少可以減少50%，復(fù)合蛋白預(yù)測精度至少提升15%。
其次，Uni-Docking是GPU極致加速的分子對接引擎。在保持篩選精度的前提下，將千萬級分子數(shù)據(jù)庫的虛擬篩選推入可及、可用、可靠的時代。與MM GB/PBSA組成虛擬篩選工作流后，準(zhǔn)確性進一步得到提升。
再次，通過模擬藥物分子與靶點結(jié)合產(chǎn)生的“誘導(dǎo)契合”效應(yīng)，Uni-IFD可以精確預(yù)測藥物與靶點的結(jié)合模式。同時，Uni-Aquasite可以通過計算得到每個水分子的自由能，尋找對藥靶結(jié)合影響較大的水分子。
此外，Uni-FEP基于自由能微擾理論、分子動力學(xué)、增強采樣算法，以化學(xué)精度高效評估蛋白質(zhì)與配體的結(jié)合親和能。同時，Uni-FEP擁有友好的交互界面和流程，多維度多次計算的整合分析讓其成為藥化科學(xué)家身邊的Assay計算工具。
值得注意的是，Hermite®為藥物研發(fā)科學(xué)家打造了基于瀏覽器的全新體驗，包括可視化、結(jié)構(gòu)化分子，最大化操作區(qū)域，靈活調(diào)整窗口，跨窗口智能化協(xié)作，這就是Hermite®，作為藥物研發(fā)科學(xué)家的手、眼、腦，加速藥物發(fā)現(xiàn)，降低研發(fā)成本，發(fā)現(xiàn)顛覆性創(chuàng)新分子實體。
這一切變革的背后，是Hermite®在底層科學(xué)算法的創(chuàng)新，為每一個藥物發(fā)現(xiàn)提供設(shè)計靈感和計算動力。
圖為：中科院院士，北京科學(xué)智能研究院院長，深勢科技首席科學(xué)顧問鄂維南致辭
發(fā)布會上，中科院院士，北京科學(xué)智能研究院院長，深勢科技首席科學(xué)顧問鄂維南致辭表示：Hermite®是“AI forScience從算法創(chuàng)新到應(yīng)用落地的里程碑實踐和代表產(chǎn)品”。鄂維南指出，AI for Science研究范式的出現(xiàn)是科技創(chuàng)新的一個重要歷史機遇。他不僅拓展了數(shù)據(jù)驅(qū)動、物理模型驅(qū)動模式的能力邊界，還有望推動二者的有機結(jié)合，為進一步解決實際問題提供理論基礎(chǔ)。同時AI for Science也極大的拉近了科學(xué)研究與實際應(yīng)用的距離。鄂維南強調(diào)，實現(xiàn)創(chuàng)新-落地閉環(huán)，既不能靠一廂情愿、也不是一蹴而就、更不會一勞永逸。實現(xiàn)創(chuàng)新-落地閉環(huán)要面向產(chǎn)業(yè)界的真需求，解決需求背后科學(xué)、工程上的真問題，要各方面的人不斷交流和碰撞。
面對AI for Science從算法創(chuàng)新到應(yīng)用落地的進一步實現(xiàn)，深勢科技創(chuàng)始人兼CEO孫偉杰在歡迎辭中表示：選擇Hermite®，是選擇與新時代接軌。孫偉杰針對當(dāng)前科學(xué)實驗中遇到的問題，特別提出了科學(xué)實驗算法的分級理論，即如何對算法設(shè)定合理的期望，怎樣的算法是可以大規(guī)模替代實驗的工業(yè)級算法。
圖為：深勢科技創(chuàng)始人兼CEO孫偉杰進行分享
他將算法分為L1至L3三個級別：L1為模仿現(xiàn)實，即對實驗結(jié)果的復(fù)制和外推；L2為預(yù)測現(xiàn)實，對現(xiàn)象的預(yù)測接近實驗精度，并有可預(yù)期的誤差范圍；L3為搜索現(xiàn)實，這就要求能夠準(zhǔn)確預(yù)測現(xiàn)象，并能從空間中直接搜索最佳結(jié)果。當(dāng)前，對于化學(xué)、生物、材料、藥物等實驗學(xué)科，并不一定追求百分之百準(zhǔn)確的算法，只要能夠大幅縮小實驗誤差，明確精度邊界，就可以大規(guī)模的替代此前的實驗?zāi)Ｊ剑源笠?guī)模推廣L2級別，積極發(fā)展L3級別的算法，將引領(lǐng)未來實驗科學(xué)算法的前進方向。
從現(xiàn)在到2025年的核心目標(biāo)，是在藥物研發(fā)的各個環(huán)節(jié)打造一系列能夠規(guī)模化替代實驗的工業(yè)級算法，把以經(jīng)驗驅(qū)動的實驗試錯模式轉(zhuǎn)變?yōu)?ldquo;計算設(shè)計-實驗驗證”的理性迭代模式。而Hermite®充分利用云計算時代軟件功能特點和優(yōu)勢，在基礎(chǔ)設(shè)施快速建設(shè)和發(fā)展的時代，能夠幫助用戶持續(xù)觸達最前沿的藥物設(shè)計算法，并以星期為單位不斷升級產(chǎn)品使用體驗，選擇Hermite®，就是選擇了持續(xù)進化。
圖為：深勢科技創(chuàng)始人兼首席科學(xué)家張林峰做算法成果分享
深勢科技產(chǎn)品的不斷進階和卓越，正是依靠了背后強大的算法工程體系支撐。深勢科技創(chuàng)始人兼首席科學(xué)家張林峰在解析底層算法成果的分享中指出：前沿算法的開發(fā)并不只是做demo、發(fā)paper那么簡單，還需要大量的算法工程比如數(shù)據(jù)工程、硬件適配、性能優(yōu)化，跟云計算的結(jié)合也需要有大規(guī)模、高復(fù)雜度系統(tǒng)建設(shè)的能力體系；更重要的是，軟件不是開發(fā)出來的而是被用出來的，發(fā)布上線只是個開始，以需求和反饋為導(dǎo)向持續(xù)優(yōu)化才是工業(yè)軟件的真正壁壘。工業(yè)軟件是“物理內(nèi)核+工程體系+研發(fā)經(jīng)驗”緊密結(jié)合的行業(yè)智慧結(jié)晶，一路走來，深勢科技已經(jīng)集結(jié)了從理論發(fā)展、算法攻堅、大規(guī)模工程建設(shè)到行業(yè)研發(fā)的一體化頂尖團隊，未來更有信心為行業(yè)提供高效穩(wěn)定、能打勝仗的解決方案。
當(dāng)AI與生命科學(xué)發(fā)生鏈接，豐富的AI工具將人工智能和物理建模相融合，開啟AI for Science的新篇章。用計算突破藥物設(shè)計，解決復(fù)雜場景下的科學(xué)難題。Hermite®不僅是深勢科技近年來在AI for Science領(lǐng)域深耕和集大成的優(yōu)秀作品，也是深勢科技伙伴們共同的杰作。例如，火山引擎為深勢科技提供了基于GPU加速的科學(xué)計算解決方案，除了提供極具性價比的高性能算力和一站式AI開發(fā)平臺，還可以根據(jù)業(yè)務(wù)流量自動彈性擴縮容，實現(xiàn)節(jié)點自愈等策略的智能運維。惠普則通過其Z系列數(shù)據(jù)科學(xué)工作站 Zbook Firefly14 G8，為深勢提供更加穩(wěn)定的服務(wù)。深勢始終相信：成就伙伴，引領(lǐng)創(chuàng)新。沒有產(chǎn)業(yè)鏈上每一個環(huán)節(jié)的緊扣，沒有行業(yè)合作者間的攜手，就無法了解需求、完善產(chǎn)品、不斷創(chuàng)新。
一場名為AI for Science的新科技革命正在悄然征服包括新藥研發(fā)在內(nèi)的多座險峰。促進AI與生命科學(xué)、藥物研發(fā)等等領(lǐng)域的深度融合，AI for Science帶來的豐富研究工具和方法，正引領(lǐng)著科學(xué)研究領(lǐng)域新范式的大踏步進階。
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